在 Windows 作業系統裡經常有許多檔案是由系統所控管的，所以在預設的情況下你看不到，而且在 DOS 模式下按 DIR 查詢檔案列表也看不到，因為 Windows 有分兩個等級來隱藏這些特殊的檔案，分別是 隱藏檔(Hidden file) 與 系統檔(System file)，像是常見的 Thumbs.db 就是用來儲存該目錄下快取資訊，例如照片縮圖等，除此之外，病毒或木馬也經常透過這手法來達到隱匿檔案的目的。
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當一台伺服器被植入木馬過後，不只系統管理者會開始緊張，對於主機的一些奇奇怪怪的檔案也會開始特別敏感。木馬程式經常會對程式檔案加上一些特殊的屬性，例如：系統檔案屬性(System file attribute)、隱藏檔案屬性(Hidden file attribute)與唯讀檔案屬性(Read-only file attribute)等。
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